撤回“亚特兰蒂斯”号后，美国宇航局约需10天才能把这架航天飞机运返发射台。能否在原定最后期限9月7日前完成发射，对宇航局而言是一大挑战。 

　　俄罗斯计划9月中旬发射“联盟”号飞船，搭载两名机组人员和一名游客。现在，“亚特兰蒂斯”号再次推迟升空，国际空间站届时可能发生“交通堵塞”。因此，美俄双方需就各自的发射计划展开协调。 

　　美国宇航局面临的另一困难是，美方希望能在白天发射“亚特兰蒂斯”号，以便航天飞机配备的拍摄装置拍下外挂燃料箱的图像。美国“哥伦比亚”号航天飞机2003年就因升空时燃料箱一块泡沫绝缘材料掉落，撞击机翼产生缝隙，返航途中高热气体进入机舱，致机毁人亡。

　　另外，继“亚特兰蒂斯”号之后，美国宇航局还计划在2010年以前进行14次航天飞机发射活动，以完成国际空间站的建设。“亚特兰蒂斯”此次推迟发射，可能使国际空间站难以如期完工。