2006年6月30日上午，在庆祝中国共产党成立85周年暨总结保持共产党员先进性教育活动大会上，中共中央政治局常委、中央书记处书记曾庆红宣读了《中共中央关于表彰全国先进基层党组织和优秀共产党员、优秀党务工作者的决定》，哈尔滨工程大学党委被授予“全国先进基层党组织”荣誉称号，跻身全国500个获此殊荣的基层党组组织之列。
　　多年来，该校党委继承发扬“哈军工”的优良传统，全面贯彻落实“三个代表”重要思想和科学发展观，坚持“党领导发展、发展中建党，党建成果保障发展进程、发展成果检验党建工作”的理念，致力于保持政治思想、工作理念与实际行动的先进性，领导学校开创了快速、协调发展的新局面，并着重从以下三个方面做好党建工作。
　　一是加强党委领导班子建设，着力提升执政治校能力，推动学校的跨越式发展。二是加强基层组织队伍建设，夯实基础、保持先进，增强凝聚力与号召力。三是重创新、求特色、务实效，加强思想政治工作，为培养国防科技工业“可靠顶用之才”提供坚强的思想保证。（金声）